پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی با استفاده از پروفایل انرژی

نویسندگان

سید شهریار عرب

مهدی صادقی

چنگیز اصلاح چی

حمید پزشک

چکیده

در این مقاله پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی بر پایه توالی اسید های آمینه آن ارائه خواهد شد. برای تعریف فاکتوری به منظور تشخیص میزان انعطاف پذیری از انرژی دو اسید آمینه متوالی استفاده شد. با استفاده از تحلیل های آماری برروی این انرژی، عددی بین صفر و صد به هر جفت اسید آمینه تعلق می گیرد که آنرا عدد انعطاف پذیری می نامیم. در نظر گرفتن اثرات همسایه ها تا چهار همسایه اسید آمینه باعث بهبود پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئین می گردد. برای ارزیابی پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی از پروتئین هایی که ساختمان آنها توسط nmr تعیین ساختار شده بود استفاده شد. عدم قطعیت در تعیین ساختار مناطقی که انعطاف پذیری بالایی دارند، مثل سر و ته زنجیره و حلقه ها باعث ایجاد مدل های مختلف ساختمانی می شود. مقایسه بین پیشگویی و پراکندگی زوایا در مدل های مختلف همبستگی بالایی را نشان می دهد که حاکی از دقت قابل اعتماد روش پیشگویی می باشد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

انعطاف پذیری از دیدگاه روان شناسی تحولی

زندگی همیشه مطابق با انتظارات ما پیش نمی‌رود، در خانواده، محیط کار و در همسایگی خود با مشکلاتی مواجه می‌شویم، روابط پایان می پذیرد، فرزندانمان خانه را ترک می‌کنند، شغلمان را از دست می‌دهیم، بیمار می‌شویم و بالأخره گاهی مرگ، افرادی که دوستشان داریم را از ما می‌گیرد، اما با این وجود، اکثر ما انسان‌ها خودمان را با این تغییرات سازگار می‌کنیم. به نظر می‌رسد این سازگاری نشانه‌ی وجود انعطاف پذیری در م...

متن کامل

جمع‌سازی خطر پذیری قیمت کالاها با استفاده از شاخص اعداد: بررسی موردی خطرپذیری قیمت فرآورده‌های پروتئینی

در برخی از بررسی های تجربی استفاده از داده‌های جمع‌سازی شده خطر پذیری قیمت کالاها پرهیز ناپذیر است. روش متداول جمع‌سازی خطر پذیری قیمت کالاها، محاسبه واریانس شاخص جمع‌سازی شده قیمت کالاها می‌باشد. اما این روش در نظریه شاخص اعداد مبنای نظری ندارد، به عنوان مثال اگر توزیع احتمال قیمت نرمال بوده و میانگین و واریانس آن در طول زمان تغییر کنند، احتمال اینکه واریانس قیمت توسط قیمت‌های انتظاری تعیین شو...

متن کامل

تمایزسوش های غالب هلیکوباکترپیلوری جدا شده از بیماران مبتلا به بیماری های مختلف گوارشی با استفاده از بررسی پروفایل پروتئینی

مقدمه: علیرغم مطالعات زیاد، هنوز بطور دقیق مشخص نیست که چه عواملی تعیین کننده ی پیامدهای متنوع عفونت ناشی از هلیکوباکتر پیلوری می باشند. بنابر این، هدف از مطالعه حاضر تمایز سوش های هیلکو باکتر پیلوری جدا شده از بیماران مبتلا به بیماری های مختلف معده براساس پروفایل های پروتئینی می باشد. مواد و روش تحقیق: پروفایل پروتئینی سوش های مختلف هیلکو باکتر پیلوری جدا شده از سه گروه بیمار مبتلا به گاستریت,...

متن کامل

اندازه گیری انعطاف پذیری مالی

تصمیم گیری درباره تامین مالی وترکیب ساختار سرمایه در شرکت ها به عوامل گوناگونی بستگی دارد. هدف اساسی تحقیق اندازه گیری انعطاف پذیری مالی شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران است. باتوجه به هدف پژوهش در مرحله اول، بر مبنای چارچوب، نظرات خبرگان مالی جهت کسب شناخت ودرک دیدگاه های آنان و مشخص ساختن ابعاد، مولفه ها، شاخص ها و عوامل تعیین کننده مدل ان...

متن کامل

بررسی فضایی انعطاف پذیری مناطق شهری پس از زلزله با استفاده از روش OWA در منطقه 12 تهران

Resilience are concepts that are finding increasing currency in several fields of research as well as in various policy and practitioner communities engaged in global environmental change science, climate change, sustainability science, disaster risk-reduction and famine interventions (Vogel, et.al, 2007). Where the risk is a probability of damage, injury, liability, loss, or any other negative...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
زیست فناوری دانشگاه تربیت مدرس

ناشر: دانشگاه تربیت مدرس

ISSN

دوره دوره 1

شماره شماره 1 2010

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023